Artículos que destacan en el ejemplar de Science del 5 de septiembre, 2008

Mayor Conocimiento Genómico de Dos de los Cánceres Más Letales: Dos nuevos estudios describen las alteraciones genómicas que ayudan a convertir células normales en dos de los cánceres más letales: glioblastoma multiforme (la forma más común de cáncer cerebral) y el cáncer pancreático. Pese a que las alteraciones genómicas específicas variaron de tumor a tumor para cada tipo de cáncer, ambos estudios revelaron que hay un grupo central de vías de señalización y procesos regulatorios que salieron mal, resultando en las enfermedades. En el primer estudio, D. Williams Parsons y colegas analizaron las secuencias de más de 20,000 genes codificadores de proteínas de 22 muestras de glioblastoma humano para detectar mutaciones potenciales. Asimismo, buscaron cambios específicos de los tumores en patrones de expresión genética, así como el número de genes copiados. Ellos descubrieron una variedad de alteraciones afectando genes que no habían sido previamente ligados a estos tumores. Un gen, el IDH1, tendía a ser mutado en los tan llamados "glioblastomas secundarios" que surgen a partir de tumores de menor grado, y también en tumores de pacientes más jóvenes. En este pequeño estudio, los pacientes cuyos tumores tenían mutaciones IDH1 tenían un tiempo de supervivencia mayor, sugiriendo que el gen IDH1 podría ser un marcador clínico útil para exploración y tratamiento, aunque los resultados tendrán que ser confirmados en un análisis mucho más amplio. En un segundo estudio, el mismo grupo de científicos examinó la composición genética del cáncer pancreático, una enfermedad que usualmente es detectada en un estado avanzado, y para la cual pocos tratamientos están disponibles. Aplicando las mismas estrategias genómicas a 24 tumores pancreáticos humanos, Sian Jones y colegas reportan que un conjunto central de 12 vías de señalización celular o procesos regulatorios fueron, cada uno, alterados genéticamente, en 70 por ciento a 100 por ciento de los tumores, sugiriendo que un trastorno en estas vías es responsable de las principales características del desarrollo de tumor pancreático. Los autores concluyen que "la mejor esperanza de desarrollo terapéutico puede radicar en el descubrimiento de agentes que apunten a los efectos fisiológicos de las vías y los procesos alterados más que a sus componentes genéticos individuales".

ARTÍCULO #20: "An Integrated Genomic Analysis of Glioblastoma Multiforme," por D.W. Parsons; S. Jones; X. Zhang; J.C-H. Li; R.J. Leary; P. Angenendt; L.A. Diaz, Jr.; N. Papadopoulos; G. Parmigiani; B. Vogelstein; V.E. Velculescu; K.W. Kinzler en Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics en Baltimore, MD; D.W. Parsons; S. Jones; X. Zhang; J.C-H. Li; R.J. Leary; P. Angenendt; L.A. Diaz, Jr.; N. Papadopoulos; G. Parmigiani; B. Vogelstein; V.E. Velculescu; K.W. Kinzler en Howard Hughes Medical Institute en Baltimore, MD; D.W. Parsons; S. Jones; X. Zhang; J.C-H. Li; R.J. Leary; P. Angenendt; L.A. Diaz, Jr.; N. Papadopoulos; G. Parmigiani; B. Vogelstein; V.E. Velculescu; K.W. Kinzler en Johns Hopkins Kimmel Cancer Center en Baltimore, MD; D.W. Parsons en Baylor College of Medicine en Houston, TX; P. Mankoo; H. Carter; I-M. Sui; G. Gallia; A. Olivi; G.J. Riggins; R. Karchin en Johns Hopkins Medical Institutions en Baltimore, MD; R. McLendon; B.A. Rasheed; S. Keir; H. Yan; D.D. Bigner en Pediatric Brain Tumor Foundation en Durham, NC; R. McLendon; B.A. Rasheed; S. Keir; H. Yan; D.D. Bigner en Preston Robert Tisch Brain Tumor Center en Duke University Medical Center en Durham, NC; T. Nikolskaya en Vavilov Institute for General Genetics en Moscú, Rusia; Y. Nikolsky en GeneGo, Inc. en St. Joseph, MI; D.A. Busam; H. Tekleab; R.L. Strausberg en J. Craig Venter Institute en Rockville, MD; J. Hartigan; D.R. Smith en Agencourt Bioscience Corporation en Beverly, MA; S.K.N. Marie; S.M.O. Shinjo en University of São Paulo School of Medicine en São Paulo, Brasil.

CONTACTAR: Hai Yan en: hai.yan@duke.edu (correo electrónico) y Gregory J. Riggins en griggin1@jhmi.edu (correo electrónico) sobre coordinación clínica y de muestras; Darell Bigner en bigne001@mc.duke.edu (correo electrónico) sobre revisión patológica y clínica; Rachel Karchin en karchin@jhu.edu (correo electrónico) sobre análisis de bio-información; Nickolas Papadopoulos en npapado1@jhmi.edu (correo electrónico) sobre análisis de expresión genética; Giovanni Parmigiani en gp@jhu.edu (correo electrónico) sobre análisis estadístico; Bert Vogelstein en bertvog@gmail.com (correo electrónico); Victor E. Velculescu en velculescu@jhmi.edu (correo electrónico), y Kenneth W. Kinzler en kinzlke@welch.jhu.edu (correo electrónico) sobre mutaciones y análisis de número de copias.

NOTICIA: Una nota informativa, redactada por Jocelyn Kaiser, en relación con el artículo estará disponible el miércoles 3 de septiembre, 2008. Material de Apoyo en Línea: Un PDF está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/.

Nota: Este artículo será publicado en línea por la revista Science, en el sitio web Science Express, el jueves, 4 de septiembre. Ver http://www.sciencexpress.org.

ARTÍCULO #21: "Pathways Underlying Pancreatic Tumorigenesis," por S. Jones; X. Zhang; D.W. Parsons; J.C-H. Lin; R.J. Leary; P. Angenendt; J.R. Eshleman; S.E. Kern; R.H. Hruban; N. Papadopoulos; G. Parmigiani; B. Vogelstein; V.E. Velculescu; K.W. Kinzler en The Sol Goldman Pancreatic Cancer Research Center en Baltimore, MD; S. Jones; X. Zhang; D.W. Parsons; J.C-H. Lin; R.J. Leary; P. Angenendt; J.R. Eshleman; S.E. Kern; R.H. Hruban; N. Papadopoulos; G. Parmigiani; B. Vogelstein; V.E. Velculescu; K.W. Kinzler en Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics en Baltimore, MD; S. Jones; X. Zhang; D.W. Parsons; J.C-H. Lin; R.J. Leary; P. Angenendt; J.R. Eshleman; S.E. Kern; R.H. Hruban; N. Papadopoulos; G. Parmigiani; B. Vogelstein; V.E. Velculescu; K.W. Kinzler en Howard Hughes Medical Institute en Baltimore, MD; S. Jones; X. Zhang; D.W. Parsons; J.C-H. Lin; R.J. Leary; P. Angenendt; J.R. Eshleman; S.E. Kern; R.H. Hruban; N. Papadopoulos; G. Parmigiani; B. Vogelstein; V.E. Velculescu; K.W. Kinzler en Johns Hopkins Kimmel Cancer Center en Baltimore, MD; D.W. Parsons en Baylor College of Medicine en Houston, TX; P. Mankoo; H. Carter; H. Kamiyama; A. Jimeno; S-M. Hong; B. Fu; M-T. Lin; E.S. Calhoun; M. Kamiyama; K. Walter; M. Hildago; S.D. Leach; A.P. Klein; E.M. Jaffee; M. Goggins; A. Maitra; C. Iacobuzio-Donahue; J.R. Eshleman; S.E. Kern; R.H. Hruban; R. Karchin en Johns Hopkins Medical Institutions en Baltimore, MD; T. Nikolskaya en Vavilov Institute for General Genetics en Moscú, Rusia; Y. Nikolsky en GeneGo, Inc. en St. Joseph, MI; J. Hartigan; D.R. Smith en Agencourt Bioscience Corporation en Beverly, MA.

CONTACTAR: James R. Eshleman en jeshlem@jhmi.edu (correo electrónico) y Scott E. Kern en sk@mail.jhmi.edu (correo electrónico) sobre coordinación clínica y de muestras; Ralph H. Hruban en rhruban@jhmi.edu (correo electrónico) sobre revisiones patológicas; Rachel Karchin en karchin@jhu.edu (correo electrónico) sobre análisis de bio-información; Nickolas Papadopoulos en npapado1@jhmi.edu (correo electrónico) sobre análisis de expresión genética; Giovanni Parmigiani en gp@jhu.edu (correo electrónico) sobre análisis estadístico; Bert Vogelstein en bertvog@gmail.com (correo electrónico), Victor E. Velculescu en velculescu@jhmi.edu (correo electrónico), y Kenneth W. Kinzler en kinzlke@welch.jhu.edu (correo electrónico) sobre mutaciones y análisis de número de copias.

NOTICIA: Una nota informativa, redactada por Jocelyn Kaiser, en relación con el artículo estará disponible el miércoles 3 de septiembre, 2008.

Material de Apoyo en Línea: Un PDF está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/.

Nota: Este artículo será publicado en línea por la revista Science, en el sitio web Science Express, el jueves, 4 de septiembre. Ver http://www.sciencexpress.org.

Revisando el Ascenso del Mar: Para el año 2100, algunos modelos de fluctuaciones del nivel del mar vaticinan un ascenso de dos metros a causa de la desintegración del hielo de Groenlandia y de Antártica. Pero, ahora los investigadores dicen que tal incremento no es realista, y que una estimación más precisa del ascenso para el 2100 estaría entre 0.8 y dos metros. Estos hallazgos, presentados por W. Pfeffer y colegas, actualizan los modelos vigentes de elevación del nivel del mar. A diferencia de la mayoría de las evaluaciones pasadas que intentan totalizar los cálculos de fuentes individuales de descarga de hielo en el mar, este experimento llevado a cabo por Pfeffer y colegas incluyó el cálculo de cuánta descarga de hielo de Groenlandia y Antártica se necesitaría para producir diversos índices de ascenso del nivel del mar, y luego evaluando qué tan realistas eran esos índices de descarga. Sus hallazgos revelan que las estimaciones actuales del ascenso del nivel del mar para el 2100 requerirían una mayor descarga de Groenlandia y Antártica que la que se haya reportado jamás, y mientras estos inflados índices no son completamente imposibles, los autores sostienen que no deberían ser adoptados como una hipótesis central de trabajo.

ARTÍCULO #15: "Kinematic Constraints on Glacier Contributions to 21st-Century Sea-Level Rise," por W.T. Pfeffer en University of Colorado en Boulder, CO; J.T. Harper en University of Montana en Bozeman, MT; S. O'Neel en Scripps Institute of Oceanography en La Jolla, CA; S. O'Neel en University of California, San Diego en La Jolla, CA.

CONTACTAR: W.T. Pfeffer en: +1-720-530-5455 (celular), ó pfeffer@tintin.colorado.edu (correo electrónico); Shad O'Neel en: +1-907-786-7088 (teléfono), ó soneel@usgs.gov (correo electrónico); Joel Harper en: +1-406-829-0671; 406-214-9311 (tels.), ó Joel@mso.umt.edu (correo electrónico)

MATERIAL VISUAL: Material visual relacionado está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/.

Entrevista Vía Podcast: Un archivo de audio de una entrevista con uno de los autores de este artículo, parte del podcast semanal de Science, estará disponible el martes, 2 de septiembre, 2008.

Material de Apoyo en Línea: Un PDF está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/.

Recordar, Repetir, Acordarse: Un singular experimento que compara el disparo de una sola neurona durante una actividad y de nuevo cuando la actividad es recordada libremente como un recuerdo muestra cómo se ve el cerebro durante un recuerdo espontáneo. Hagar Gelbard-Sagiv y colegas mostraron fragmentos de Los Simpson y otros programas de televisión a un pequeño grupo de pacientes epilépticos con electrodos cerebrales implantados de manera terapéutica, monitoreando la actividad de neuronas individuales en el hipocampo cerebral y estructuras relacionadas mientras pasaban los programas. Conforme la gente recordaba libremente los programas minutos más tarde, las mismas neuronas incrementaron nuevamente su ritmo de disparo. Las neuronas cobraron vida incluso antes de que la gente le dijera a los investigadores que su recuerdo del programa había "venido a la mente" sugiriendo un vínculo directo entre recuerdo libre y "repetición" neuronal en esta porción del cerebro. Cuando usted recuerda ese momento en que conoció a su primer amor, una constelación siempre cambiante de neuronas dispara en su cerebro. Durante mucho tiempo, los investigadores han formado hipótesis respecto a que cada patrón de disparo debe ser específico para un recuerdo en particular y debería ser el mismo independientemente de dónde o cuándo se tenga ese recuerdo, o qué lo haya provocado. Un nuevo estudio en ratas ha confirmado ahora esta hipótesis. Las ratas no se enamoraron, al menos hasta donde se sabe; solamente fueron entrenadas para correr a través de diferentes brazos de un laberinto, cambiando de un brazo a otro. También tuvieron que correr en una rueda entre cada viaje al laberinto. La jaula estaba obscura y en silencio durante este intervalo, por lo que había pocos estímulos ambientales que las ratas tuvieran que procesar. Para completar exitosamente la tarea, las ratas tenían que recordar, mientras corrían en la rueda, qué brazo acababan de usar para poder decidir por qué brazo entrar la siguiente vez. Eva Pastalkova y colegas registraron la actividad de múltiples neuronas en los cerebros de las ratas mientras éstas completaban estos ejercicios. Los investigadores observaron los mismos patrones de actividad, completados durante el mismo curso temporal, durante su recorrido por el laberinto y su carrera en la rueda. Estos patrones probablemente representan los recuerdos de las ratas de su carrera a través del primer brazo del laberinto, dicen los autores.

ARTÍCULO #11: "Internally Generated Cell Assembly Sequences in the Rat Hippocampus," por E. Pastalkova; V. Itskov; A. Amarasingham; G. Buzsáki en Rutgers University en Newark, NJ; V. Itskov en Columbia University en Nueva York, NY.

CONTACTAR: György Buzsáki en buzsaki@axon.rutgers.edu (correo electrónico)

MATERIAL VISUAL: Material visual relacionado está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/. Entrevista Vía Podcast: Un archivo de audio de una entrevista con uno de los autores de este artículo, parte del podcast semanal de Science, estará disponible el martes, 2 de septiembre, 2008.

NOTICIA: Una nota informativa, redactada por Greg Miller, en relación con el artículo estará disponible el miércoles 3 de septiembre, 2008.

Material de Apoyo en Línea: Un PDF está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/.

ARTÍCULO #23: "Internally Generated Reactivation of Single Neurons In Human Hippocampus During Free Recall," por "H. Gelbard-Sagiv; M. Harel; R. Malach " en Weizmann Institute of Science en Rehovot, Israel; R. Mukamel; I. Fried en University of California, Los Angeles David Geffen School of Medicine en Los Angeles, CA; R. Mukamel; I. Fried en "University of California Los Angeles, Semel Institute for Neuroscience and Human Behavior" en Los Angeles, CA; I. Fried en Tel Aviv University, Sackler School of Medicine en Tel Aviv, Israel.

CONTACTAR: Itzhak Fried en: +1-310-825-8409 (tel.), ó ifried@mednet.ucla.edu (correo electrónico)

NOTICIA: Una nota informativa, redactada por Greg Miller, en relación con el artículo estará disponible el miércoles 3 de septiembre, 2008. Nota: Este artículo será publicado en línea por la revista Science, en el sitio web Science Express, el jueves, 4 de septiembre. Ver http://www.sciencexpress.org.

¿Un Potenciador Genético Humanizó Nuestras Manos?: Investigadores han identificado una secuencia no codificadora en el genoma humano que mejora la expresión genética en la mano y el antebrazo en desarrollo, particularmente en la unión con la muñeca y el pulgar. La secuencia, llamada HACNS1, evolucionó rápidamente en humanos en comparación con los chimpancés y los monos macacos, y podría haber jugado un papel en la "humanización" de nuestras manos y pies, según Shyam Prabhakar y colegas. A través de la creación de embriones de ratón con la secuencia HACNS1, los investigadores fueron capaces de observar su efecto en la expresión genética en el desarrollo de la extremidad anterior y la extremidad posterior, pero aún no está claro qué gen o genes fueron considerados blanco por la secuencia. Sin embargo, parece que la función "potenciadora" del HACNS1 es única para humanos. Algunos genes son atendidos por múltiples secuencias potenciadoras, incluyendo algunas que comparten funciones con un potenciador primario pero que se encuentran lejos del gen considerado como objetivo. Los estudios de Drosophila de Joung-Woo Hong y colegas sugieren que estos "potenciadores sombra" evolucionan más rápidamente que sus potenciadores primarios relacionados, abriendo la puerta a nuevas formas de regular un gen particular sin trastornar su función central. En un Perspective relacionado, Gregory Wray y Courtney Babbitt hablan de cómo Prabhakar, Hong y sus colegas abordaron el reto de buscar regiones no codificadoras del genoma que tienen efectos regulatorios de largo alcance.

ARTÍCULO #4: "Enhancing Gene Regulation," por G.A. Wray; C.C. Babbitt en Duke University en Durham, Reino Unido.

CONTACTAR: Gregory A. Wray en: +1-919-684-6696 (oficina), +1-919-360-9379 (celular), ó gwray@duke.edu (correo electrónico)

ARTÍCULO #9: "Shadow Enhancers as a Source of Evolutionary Novelty," por J-W. Hong; D.A. Hendrix; M.S. Levine en University of California, Berkeley en Berkeley, CA.

CONTACTAR: Michael S. Levine en: +1-510-642-5014 (tel.), ó mlevine@berkeley.edu (correo electrónico)

Material de Apoyo en Línea: Un PDF está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/.

ARTÍCULO #17: "Human-Specific Gain of Function in a Developmental Enhancer," por S. Prabhakar; A. Visel; J.A. Akiyama; M. Shoukry; K.D. Lewis; A. Holt; I. Plajzer-Frick; V. Afzal; L.A. Pennacchio; E.M. Rubin; J.P. Noonan en Lawrence Berkeley National Laboratory en Berkeley, CA; H. Morrison; D.R. FitzPatrick en MRC Human Genetic Unit, Western General Hospital en Edimburgo, Reino Unido; L.A. Pennacchio; E.M. Rubin en U.S. Department of Energy Joint Genome Institute en Walnut Creek, CA; S. Prabhakar en Genome Institute of Singapore en Singapúr, Singapúr; K.D. Lewis en California Institute of Technology en Pasadena, CA; J.P. Noonan en Yale University School of Medicine en New Haven, CT.

CONTACTAR: James P. Noonan en: +1-203-737-1922 (tel.), ó james.noonan@yale.edu (correo electrónico)

Material de Apoyo en Línea: Un PDF está disponible en http://www.eurekalert.org/jrnls/sci/.