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PUBLIC RELEASE DATE: 29 Junio 2005

Científicos de España, Estados Unidos y Canadá construyen un mapa físico del genoma de Drosophila buzzatii



Alfredo Ruiz

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Un equipo internacional de investigadores dirigido por el profesor de la UAB Alfredo Ruiz ha anunciado, en un articulo publicado este mes en la revista Genome Research, el primer mapa fsico de los cromosomas de Drosophila buzzatii, una mosca utilizada en diversos lugares del mundo como modelo para los estudios de gentica evolutiva.

El trabajo se ha desarrollado en dos etapas. La primera ha consistido en obtener una "biblioteca genmica" de esta especie. Se trata de una coleccin de ms de 18.000 fragmentos del genoma de la mosca insertados al azar dentro de bacterias. Cada clon bacteriano es portador de uno de estos fragmentos, de unos 150.000 nucletidos de tamao, y se puede multiplicar en un cultivo en el laboratorio para extraer el ADN de la mosca.

En la segunda etapa, la construccin del mapa fsico del genoma, los fragmentos desordenados de la biblioteca se ordenaron de la misma manera que se encuentran en los cromosomas intactos. Es como montar un puzzle con miles de piezas. Los autores de este trabajo utilizaron dos mtodos para reconstruir los cromosomas de Drosophila buzzatii. Uno de ellos, denominado "fingerprinting" consiste en cortar cada uno de los clones originales en decenas de pequeos fragmentos, cuyo tamao se puede despus determinar. Comparando informticamente los patrones de fragmentos producidos por los diferentes clones, se puede deducir qu clones provienen de la misma regin cromosmica. El segundo mtodo utilizado fue la "hibridacin in situ": los clones se hibridaron sobre los cromosomas gigantes de las glndulas salivares de las larvas, lo que permite localizar la posicin de cada un de ellos en estos cromosomas (ver imagen).

El mapa fsico del genoma de la especie Drosophila buzzatii es uno de los ms completos jams obtenidos entre las diferentes especies del gnero Drosophila. Su importancia se debe a que la especie Drosophila buzzatii es ampliamente usada en estudios sobre la evolucin del genoma, la adaptacin ecolgica y la especiacin. Ahora, con la biblioteca genmica y el mapa fsico, para la comunidad cientfica internacional ser ms fcil comparar el genoma de Drosophila buzzatii con el de otras especies similares, y tambin ensamblar las secuencias obtenidas cuando los genomas de estas especies se secuencien completamente.

La investigacin ha sido dirigida por el profesor del Departamento de Gentica y de Microbiologa de la UAB Alfredo Ruiz, pero han participado en ella otros 13 investigadores de la UAB, del Children's Hospital Oakland Research Institute, en Oakland, California (Estados Unidos), del Genome Sciences Centre, en Vancuver (Canad), y del Lawrence Berkeley National Laboratory, en Berkeley, California (Estados Unidos).

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