La UAB crea el primer servidor de internet para buscar diversidad genética

Investigadores de la Universitat Autònoma de Barcelona han desarrollado el primer servidor internacional que permite analizar a gran escala la diversidad genética. El servidor recibe el nombre de PDA (Pipeline Diversity Analysis) y, por vez primera, los biólogos de todo el mundo pueden buscar pequeñas variaciones en los genomas de diferentes individuos y de diferentes especies directamente a partir de los datos archivados en las grandes bases de datos públicas de genómica, como el GenBank.

Estas variaciones son la clave para entender la gran diversidad de seres vivos que habitan la Tierra, así como la gran diversidad que existe entre los diferentes individuos de una misma especie. En el caso de nuestra especie, son las que determinan que una persona tenga los ojos azules o marrones, la piel clara u oscura, o el grado de riesgo de sufrir un determinado tipo de cáncer. Por ello, la variabilidad genética, además de ser un elemento clave en biología evolutiva y en biología básica, se ha convertido en uno de los grandes polos de la investigación científica en el campo de la genómica.

El servicio web, creado por Sonia Casillas y Antonio Barbadilla y publicado este mes de julio en la edición especial sobre servidores bioinformáticos de la revista Nucleic Acids Research, consiste en un conjunto de programas que, de modo automático, buscan las secuencias que hay en las grandes bases de datos públicas de ADN, las agrupan y miden la diversidad genética en diferentes regiones. Es decir, buscan lo que los científicos llaman polimorfismos nucleotídicos, las pequeñas variaciones en las "letras" de la molécula de ADN que configuran la información genética, que hay entre diferentes indivíduos de una especie.

La creación de herramientas bioinformáticas que automatizan la búsqueda y el análisis de datos es hoy una de las prioridades que tiene la investigación biomédica para tratar el alud de datos moleculares que se generan a escala mundial. El servidor PDA está disponible para su uso por la comunidad científica en la dirección de Internet http://pda.uab.es