Contact: Doris Prince
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Institut de Cardiologie de Montréal
Marc Tulin
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Université de Montréal
« Cette nouvelle carte est une précieuse source d’information dont les chercheurs se serviront pour trouver les gènes qui influencent la santé, la maladie et la réponse aux médicaments. Elle fournira les renseignements nécessaires à la conception d’études convaincantes visant à identifier les facteurs de risque génétiques situés dans le CMH », a déclaré l’auteur principal, le Dr John D. Rioux, Ph.D., professeur agrégé de médecine à l'UdeM et à l’ICM où il œuvre en tant que chercheur et directeur du Laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation (www.inflammgen.org), chercheur associé du Broad Institute du MIT et de Harvard et titulaire de la Chaire de recherche du Canada en génétique et en médecine génomique de l’inflammation.
Le CMH, plus précisément les gènes qui le composent, est associé à plus de maladies que toute autre région du génome humain. Au nombre de ces maladies figurent des affections courantes comme l’athérosclérose, l’arthrite, le diabète, le VIH, le lupus, la sclérose en plaques et la maladie de Crohn. Par ailleurs, deux facteurs compliquaient l’identification précise des changements causaux dans ces maladies : le degré extrêmement élevé de diversité génétique dans le CMH selon la personne et la tendance à hériter des groupes de différences génétiques, appelés « haplotypes » dans cette région.
Pour caractériser les modèles d’haplotypes du CMH, les chercheurs ont analysé la variabilité dans sa séquence d’ADN chez plus de 350 personnes provenant de diverses régions géographiques, notamment d’Afrique, d’Europe, de la Chine et du Japon. Plus précisément, les chercheurs ont analysé environ 7 500 modifications d’une seule lettre dans le code génétique, appelés des polymorphismes de nucléotide simple (SNP), simultanément avec de courts segments de la séquence d’ADN d’un ensemble de gènes très variables dans le CMH, appelés les gènes HLA. Ces gènes forment une empreinte distinctive qui est reconnue par le système immunitaire d’une personne pour faire la différence entre des tissus exogènes (étrangers) et des tissus endogènes (qui lui appartiennent). Les séquences d’ADN de ces gènes sont fréquemment analysées (un processus appelé le typage HLA) chez les personnes qui subissent une transplantation d’organe ou qui souffrent d’une maladie auto-immune.
Avant tout, les données et les analyses des chercheurs, qui sont accessibles en ligne à l’ensemble de la communauté scientifique, procurent les outils nécessaires à l’amorce d’efforts initiaux visant à identifier les facteurs de risque génétiques présents dans le CMH et spécifiques à des maladies courantes d’origine immunologique. Des chercheurs de l’Institut de Cardiologie de Montréal, de l’University of California à San Francisco et du Broad Institute du MIT et de Harvard sont déjà à l’œuvre en ce qui a trait à certaines maladies du système immunitaire.
De plus, les résultats font mieux comprendre l’évolution de la région du CMH, ses origines et les forces influentes qui ont contribué à la façonner avec le temps. Les constatations font aussi valoir que l’analyse de certains PNS à l’intérieur des gènes HLA pourrait se révéler une option moins coûteuse pour caractériser les variantes génétiques les plus communes dans la région que les méthodes de typage HLA habituelles.
Près des trois quarts des échantillons d’ADN analysés par les scientifiques avaient déjà été étudiés dans le contexte du projet international de cartographie des haplotypes (HapMap), une initiative de collaboration scientifique mondiale visant à cataloguer les variations génétiques humaines dans l’ensemble du génome. Les plus récentes constatations, en particulier les analyses de la région des gènes HLA, offrent des renseignements nouveaux et complémentaires qui peuvent être intégrés aux données du récent projet HapMap et d’autres efforts en génomique, pour donner une vue d’ensemble complète de la variabilité génétique dans le CMH humain.
Accès aux données
Les données tirées du projet seront accessibles au public au site Web suivant :
de Bakker P.I.W. et al. (2006) A high resolution HLA and SNP haplotype map for disease association studies in the extended human MHC. Nature Genetics doi:10.1038/ng1885
Une liste complète des auteurs de l’étude et de leurs affiliations :
Paul I.W. de Bakker1,2,16, Gil McVean3,16, Pardis C. Sabeti1,16, Marcos M. Miretti4,16, Todd Green1, Jonathan Marchini3, Xiayi Ke5, Alienke J. Monsuur6, Pamela Whittaker4, Marcos Delgado4, Jonathan Morrison4, Angela Richardson1, Emily C. Walsh1, Xiaojiang Gao7, Luana Galver8, John Hart9, David A. Hafler10, Margaret Pericak-Vance9, John A. Todd11, Mark J. Daly1,2, John Trowsdale12, Cisca Wijmenga6, Tim J. Vyse13, Stephan Beck4, Sarah Shaw Murray8, Mary Carrington7, Simon Gregory9, Panos Deloukas4, John D. Rioux1,14,15
1Program in Medical and Population Genetics, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts, É.-U.
2Center for Human Genetic Research, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts, É.-U.
3Department of Statistics, University of Oxford, Oxford, Royaume-Uni
4Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Royaume-Uni
5Wellcome Trust Centre for Human Genetics, University of Oxford, Royaume-Uni
6Complex Genetics Section, Department of Medical Genetics, University Medical Center Utrecht, Pays-Bas
7Laboratory of Genomic Diversity, SAIC-Frederick, Inc., NCI-Frederick, Frederick, Maryland, É-U.
8Illumina, Inc., San Diego, California, É.-U.
9Center for Human Genetics, Duke University Medical Center, Durham, North Carolina, É.-U.
10Brigham and Women’s Hospital, Department of Neurology, Boston, Massachusetts, É.-U
11Juvenile Diabetes Research Foundation/Wellcome Trust Diabetes and Inflammation Laboratory, Cambridge Institute for Medical Research, University of Cambridge, Royaume-Uni
12Cambridge Institute for Medical Research, Addensbrookes Hospital, Hills Road, Cambridge, Royaume-Uni
13Imperial College of London, Londres, Royaume-Uni
14Université de Montréal, Département de médecine, Montréal, Québec, Canada
15Institut de Cardiologie de Montréal, Montréal, Québec, Canada
16Ces auteurs ont contribué à parts égales.
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