用于研究IPF和纤维化疾病的深度学习模型 (IMAGE)
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(A)本文提出了两种深度学习模型:一种“组学Transformer”能够根据文本提示生成差异基因表达谱,另一种“路径感知蛋白组老化时钟”则在英国生物银行蛋白组数据上进行训练。这些模型主要关注与特发性肺纤维化(IPF)相关的生物学通路,包括TGF-β信号通路、氧化应激、炎症以及细胞外基质(ECM)重塑。 (B)路径感知蛋白组老化时钟的架构。该神经网络对蛋白水平测量进行特征提取,这些特征提取层分别分支到年龄预测模块和通路特异性注意力机制,使老化预测不仅可解释,同时具备路径感知能力。
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英矽智能
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