News Release 

GTEx研究揭示了基因表达的个体间差异,该差异受到性别的轻度影响

American Association for the Advancement of Science

{CATEGORYLINE}

发表在《科学》Science 与《科学进展》Science Advances杂志上的7项新的研究介绍了基因型-组织表达(GTEx)研究计划的第3和最后阶段的结果;科学家们在10多年前启动了该研究,旨在更好地了解基因多样性在健康个体中的作用。基于组织和个体数量的增加,这些结果揭示了基因表达中的人群特异性和性别特异性差异,后者或对了解基因变异会如何影响衰老和疾病有所帮助。

GTEx项目探讨的一个问题是,男女性基因表达的性别差异(这种性别差异在哺乳动物中广泛存在)是如何形成的。在这组由Meritxell Oliva进行的一个研究中,研究人员报告,超过三分之一的基因会在至少一种组织中显示性别偏向性表达,那些显示性别间差异的基因会富集于多个通路,包括存在于免疫反应和癌症中的通路。作者假设,这可能促成了某些疾病潜在的性别特异性调节障碍。Oliva和同事的研究还显示了基因表达的性别差异会如何根据组织内细胞类型、在整个基因组中及在个体间而不同。在一篇《视角》中,Melissa A. Wilson强调了他们的发现对研究界的功用;她说,这是一个将来可用于比较病变组织的资源。她指出,未来的研究需要纳入男女两性的样本来解释这些发现:“病例与对照细胞类型中的不同性别比例对基因表达信号的驱动力会超过目标表型的驱动力。”《科学》杂志上的其它4项GTEx研究讨论了基因调控在人体组织中的作用(Francois Aguet等人的研究),确定了功能上罕见的基因变异(Nicole Ferraro等人的研究),研究了端粒长度的预测因子(Kathryn Demanelis等人的研究),报告了细胞类型特异性基因调控(Sarah Kim-Hellmuth等人的研究)。Aine Duffy等人在《科学进展》杂志上发表的一项研究用英国生物库中36万人的数据探索了组织特异性差异如何能被用于了解药物副作用,后者常会导致药物在临床试验中的失败。他们的研究凸显了对组织特异性药物输送的需求。在《科学进展》杂志上发表的第2个研究中,Milton Pividori等人用一种名为PhenomeXcan的工具分析了来自49个组织的4091个性状;他们将这些结果转化为一个基于基因的、包括了2万2515个基因的可搜索平台。通过应用一种能帮助识别可能具因果关系的基因-性状关联的方法,他们的分析可帮助了解哪些复杂的基因性状可能成为治疗标靶,而这在过去是很难做到的。

Wilson在她撰写的《视角》中强调了这项工作及其透明共享样本集的宝贵贡献,但她也发现了阻碍个体间变异研究的抽样偏差。仅超过三分之二的样本来自男性,一半以上的样本来自50岁或以上的人,而近85%的样本来自欧洲血统的白人。她断定:“鉴于样品存在的这些局限性,在被GTEx Consortium纳入者基因表达中所观察到的个体间差异之大则更令人惊讶,它应该对人类遗传学家有激励作用。这应该是对今后研究中扩大人类变异项目代表性的一个呼吁。

###

Disclaimer: AAAS and EurekAlert! are not responsible for the accuracy of news releases posted to EurekAlert! by contributing institutions or for the use of any information through the EurekAlert system.