図1 本研究成果の概要図 (IMAGE)
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・左上から時計回りに、(a) 本研究の解析パイプライン、(b) ddPCRの結果、(c) digital RNA-Seqの結果、 (d)1細胞RNA-Seqの結果、 (e) LM-PCRの結果を示す。 ・(a)、(b)、(c) の灰色は非感染マウス由来のCD4 T細胞、赤色はHIV1-GFP感染マウス由来のウイルス非産生CD4 T細胞、緑色はHIV1-GFP感染マウス由来のウイルス産生CD4 T細胞を示す。 ・(d)は、 1細胞RNA-Seq結果を基に分類した9つの異なる細胞亜集団 (cluster)を各色で示したもの。(上) : 1細胞RNA-Seq結果の次元圧縮結果 (左下) : 9つの異なる細胞亜集団 (cluster)におけるCXCL13の発現量 (右) : 9つの異なる細胞亜集団 (cluster)におけるインターフェロン誘導遺伝子の発現量。
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©佐藤佳
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