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Credit: Hongyang Wang, Ying Zheng, Tiantian Wang, Xue Zhang, Peipei Wang, Chuancun Wei, Hongyue Li, Quan Wang, Lu Zhang, Xisong Ke, Wenqing Xu
在细胞这个繁忙而有序的世界里,蛋白质的“寿命”通常由泛素-蛋白酶体途径来决定——这曾被认为是蛋白质降解的“黄金准则”。近期发现Midnolin-蛋白酶体途径以非泛素化依赖的方式,直接招募底物进行降解。Midnolin作为调控蛋白质稳态的关键因子,介导细胞核内底物如即刻早期基因编码的蛋白(如c-FOS、EGR1)及其他细胞类型特异性转录调节因子(如IRF4)的精准快速降解,响应细胞内应激与代谢信号的动态变化。
近日,来自上海科技大学的许文青教授团队在Protein & Cell杂志发表了题为Structure-based engineering of the midnolin-proteasome pathway for targeted protein degradation的研究文章,该研究解析了midnolin-蛋白酶体复合物的冷冻电镜结构,并开发了全球首个基于midnolin的靶向蛋白降解平台——MidTAC,为治疗“不可成药”靶点相关疾病(如癌症)带来了全新的希望!
Midnolin-蛋白酶体途径:独特的双臂蛋白酶体结合策略,高效降解蛋白
该团队运用冷冻电镜(cryo-EM)技术解析了midnolin-蛋白酶体复合物的高分辨率结构,揭示了midnolin与蛋白酶体结合并介导底物降解的三种不同构象(图1)。结构与生化实验结果表明Midnolin的C端α螺旋(C-Helix)紧固锚定在蛋白酶体RPN1亚基上,而其N端泛素样结构域(UBL)则与蛋白酶体RPN11亚基发生相互作用,形成独有的双臂蛋白酶体结合模式。因此,招募底物的Midnolin Catch结构域在空间上精确定位于蛋白酶体AAA-ATP酶马达上方,方便底物去折叠及降解。该研究成功捕捉了Midnolin从C-Helix锚定、UBL识别到底物加工的动态构象变化过程,为阐明Midnolin直接募集底物至蛋白酶体降解的分子机制提供了关键结构证据。
图1 Midnolin-蛋白酶体复合物的冷冻电镜结构
MidTAC:直接精准递送目标蛋白至蛋白酶体的全新蛋白降解策略
靶向蛋白质降解(TPD)方法,如PROTAC和分子胶,已革新了药物研发领域。然而,由于可用E3的匮乏和泛素化及去泛素化过程的复杂性,这些依赖泛素化的方法在具体治疗应用中面临诸多挑战。不依赖泛素化的蛋白酶体降解途径,或将成为解决该领域关键挑战的最佳方案。因此,基于对midnolin与26S蛋白酶体相互作用机制的深入理解,研究团队开发了名为MidTAC(Midnolin-based Targeting Chimera)的靶向蛋白质降解技术(图2)。MidTAC技术将Midnolin的Catch结构域替换为特定靶蛋白的结合结构域或基序,可特异性地引导靶蛋白至蛋白酶体进行降解。最令人振奋的是,MidTAC在HEK293T细胞内成功实现了对细胞核内β-catenin的特异性降解,且不影响细胞质中参与细胞黏附功能的 β-catenin含量。这一特性对于治疗由Wnt信号通路异常激活所驱动的癌症(如结直肠癌)具有重要意义。MidTAC展现出了高度的蛋白靶向特异性,为开发针对“不可成药”靶点的新型治疗策略提供了重要工具,具有广阔的临床转化潜力。
图2 MidTAC靶向蛋白降解技术的工作示意图
未来展望
MidTAC技术的诞生,意味着我们有望:1)靶向那些缺乏泛素化位点的蛋白;2)攻克传统E3连接酶无法识别的“不可成药”靶点;3)实现亚细胞定位特异性的蛋白降解,提升治疗精准性;4)开发出更安全、更高效、副作用更小的新型抗肿瘤药物。随着我们对这条蛋白降解捷径了解的加深,或许不久的将来就能见证更多基于此蛋白降解机制的创新疗法问世。
Journal
Protein & Cell
Method of Research
Experimental study
Subject of Research
Not applicable
Article Title
Structure-based engineering of the midnolin-proteasome pathway for targeted protein degradation
Article Publication Date
20-Aug-2025