image: Glycopeptide preparation is a critical step in bottom-up glycoproteomics. This study evaluated a streamlined and cost-effective method for N-glycopeptide preparation using commercially available magnetic particles. The method was evaluated for plasma/serum and tissue sample preparation, and N-glycopeptides that increased in cancer were identified in patients with gastric cancer.
Credit: Institute for Glyco-core Research (iGCORE), Gifu University
【本研究のポイント】
・ プロテオミクスの前処理方法であるSP3法を基盤に、糖ペプチドを一気通貫で調製す
る方法を確立しました。
・ 市販のセルロース磁性粒子を用いることにより、糖ペプチドの純度が向上しました。
・ 血液試料や組織試料から高純度な糖ペプチドを効率的に回収することが可能になりま
した。
・ 本技術は、疾患に関連する糖鎖を網羅的に示す「疾患関連糖鎖カタログ」を構築する基
盤技術として活用されることが期待されます。
【研究概要】
岐阜大学糖鎖生命コア研究所の中嶋和紀准教授、半澤健研究員、ネムチッチ・マティ研究員らの研究グループは、大阪国際がんセンターの宮本泰豪臨床検査科副部長、岡本三紀チームリーダーとの共同研究により、糖鎖が結合したタンパク質を大規模に解析するための、糖ペプチド調製法を確立しました。
糖ペプチドの網羅的解析「グライコプロテオミクス」は、疾患バイオマーカー探索において有力なアプローチです。現在、国内で進められているヒューマングライコームプロジェクトでは、糖鎖の多検体分析を通じて、疾患と関連する糖鎖を探索してカタログ化を行います。しかし、これまでの試料調製法は、原理としては確立されていたものの、多検体を効率的に分析する上では限界がありました。
本研究では、磁性粒子を用いてペプチドを集めるSP3（Single-pot, solid-phase-enhanced sample-preparation）法に着目しました。糖ペプチドは液体クロマトグラフ質量分析計による分析においてイオン化しにくいため、糖ペプチドを高純度に精製することが重要です。そこで本研究では、N-型糖ペプチドの調製に適したセルロース磁性粒子を選定し、ペプチド断片化から糖ペプチド精製までを一気通貫で行うことができる試料調製法を確立しました。この方法により、血清・血漿、組織試料から、糖ペプチドを高純度に集めることが可能になりました。近い将来、本技術がグライコプロテオミクスの全自動装置に実装され、新たな糖鎖バイオマーカーの発見や、新しい診断システムの開発につながることが期待されます。
本論文は、現地時間2026年8月11日付で「Molecular & Cellular Proteomics」誌に掲載されました。なお、本研究は、文部科学省の大規模学術フロンティア促進事業「ヒューマングライコームプロジェクト」の支援を受けて実施しました。
【研究の詳細】
https://www.gifu-u.ac.jp/news/research/uploads/20260827press01.pdf
Journal
Molecular & Cellular Proteomics
Method of Research
Experimental study
Subject of Research
Human tissue samples
Article Title
N-Glycoproteomics sample preparation using commercially available cellulose magnetic particles
Article Publication Date
11-Aug-2026