image: In a study published in Scientific Reports, researchers at MELISA Institute compared two proteomics methods using the same 42 samples from the EARLY-PREG preconception cohort. Each of the six participants provided one sample per day for seven consecutive days during a cycle without conception. With dia-PASEF, the team quantified 4,229 proteins, compared with 2,817 using dda-FracOffline (about 50% more). Measurements were more consistent with dia-PASEF, which also detected more proteins whose levels differed from those measured on the first day. The method provides a basis for future research on fertility, the earliest stages of pregnancy, and potential biomarkers of gynecological disease.
Credit: MELISA Institute
Em um estudo pioneiro com amostras de fluido cervicovaginal do biobanco EARLY-PREG, pesquisadores do MELISA Institute validaram um método de análise proteômica que quantificou cerca de 50% mais proteínas que o método de comparação. Com amostras coletadas da mesma mulher em dias consecutivos, é possível acompanhar como a abundância das proteínas varia de um dia para o outro. O método abre novas possibilidades para estudar a fertilidade, as fases iniciais da gestação e biomarcadores de interesse clínico na coorte pré-concepcional EARLY-PREG.
Um estudo do MELISA Institute, publicado na revista Scientific Reports, da Nature Portfolio, mostra como acompanhar milhares de proteínas do fluido cervicovaginal ao longo de sete dias consecutivos. Com amostras coletadas diariamente das mesmas mulheres, a equipe comparou dois métodos quanto à capacidade de detectar mudanças na abundância das proteínas.
A EARLY-PREG é uma plataforma de pesquisa baseada em uma coorte longitudinal pré-concepcional. As participantes são acompanhadas desde antes da gravidez. O biobanco registra o momento de cada coleta em relação ao ciclo menstrual da participante, o que permite interpretar cada medida molecular em seu contexto biológico.
A equipe utiliza o pico do hormônio luteinizante (LH) na urina como referência para a ovulação. Assim, é possível acompanhar mudanças em cada mulher ao longo do tempo e comparar as medidas de diferentes participantes em momentos equivalentes do ciclo.
Um olhar molecular sobre o ciclo menstrual
O fluido cervicovaginal pode ser coletado por um procedimento minimamente invasivo e contém proteínas envolvidas em diversos processos do trato reprodutivo feminino. A análise de seu proteoma, o conjunto de proteínas presentes no fluido, permite investigar como a abundância dessas proteínas varia ao longo do tempo.
Para a validação do método, a equipe selecionou 42 amostras do biobanco provenientes de seis mulheres, todas coletadas em ciclos sem concepção. Cada participante forneceu uma amostra por dia, do dia do pico urinário de LH (d0) até o sexto dia após o pico (d6). Os dois métodos foram comparados nas mesmas amostras. As análises utilizaram um sistema de cromatografia líquida nanoElute acoplado a um espectrômetro de massas timsTOF Pro, ambos da Bruker Daltonics.
Com o método dia-PASEF, a equipe quantificou 4.229 proteínas, ante 2.817 com o método de comparação, dda-FracOffline: um aumento de cerca de 50%. As medidas foram mais consistentes com dia-PASEF, que também detectou mais proteínas cuja abundância diferia da observada no dia de referência.
“Quando comparamos amostras de uma mesma mulher em dois dias diferentes, precisamos saber se a abundância de uma proteína mudou ou se a diferença se deve à própria medição. Com o dia-PASEF, obtivemos medidas mais consistentes e detectamos mais proteínas cujos níveis variaram de um dia para outro”, explica Mauricio Hernández, chefe de Laboratório do MELISA Institute.
Nas condições do estudo, o tempo de aquisição de dados no equipamento foi de aproximadamente uma hora por amostra com dia-PASEF, em comparação com 16 horas com dda-FracOffline. A redução desse tempo poderia facilitar estudos longitudinais de maior porte, nos quais cada participante fornece várias amostras.
Uma plataforma para investigar a fertilidade e as fases iniciais da gestação
Um dos objetivos da EARLY-PREG é investigar a comunicação entre mãe e embrião no período em torno da implantação. A validação do método fornece uma base para futuros estudos que comparem as mudanças na abundância de proteínas em ciclos com e sem concepção.
“Na EARLY-PREG, cada amostra vem acompanhada de uma informação decisiva: em que momento do ciclo ela foi coletada. Acompanhamos as mulheres desde antes da concepção porque queremos investigar in vivo uma questão que seria difícil estudar de outra forma: como a mãe e o embrião se comunicam nos dias em torno da implantação?”, afirma o Dr. Elard Koch, Chairman do MELISA Institute.
A equipe também acompanhou as variações diárias de CA-125 e HE4, proteínas já estudadas como biomarcadores de câncer de ovário e de endométrio. Estudos futuros em populações clínicas poderão avaliar se mudanças nesses marcadores ao longo do tempo são úteis para o diagnóstico ou para acompanhar a evolução da doença e a resposta ao tratamento.
O estudo validou um método de medição. Os achados biológicos são exploratórios e precisam ser confirmados em coortes maiores. Aplicações clínicas exigirão estudos específicos de desempenho diagnóstico e utilidade clínica.
Na região de Biobío, no Chile, o MELISA Institute reúne acompanhamento pré-concepcional, um biobanco longitudinal e análise molecular para estudar a saúde reprodutiva das mulheres.
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Artigo: Hernandez M. et al. A dia-PASEF workflow improves proteome coverage and quantitative performance in repeated-measures analysis of cervicovaginal fluid from a preconception cohort (EARLY-PREG). Scientific Reports (2026). DOI: 10.1038/s41598-026-75386-3.
Registro do EARLY-PREG: ClinicalTrials.gov, NCT07358026. Dados proteômicos: ProteomeXchange/PRIDE, PXD071350.
Financiamento: Fundación de Investigación San Ramón (FISAR). A pesquisa em proteômica recebeu apoio do projeto REH042024-01.
Contato científico: Dr. Elard Koch · ekoch@melisainstitute.org.
Journal
Scientific Reports
Method of Research
Experimental study
Subject of Research
Human tissue samples
Article Title
A dia-PASEF workflow improves proteome coverage and quantitative performance in repeated-measures analysis of cervicovaginal fluid from a preconception cohort (EARLY-PREG)
Article Publication Date
13-Oct-2026
COI Statement
The authors declare no competing interests.