image: The Embryonic.AI system was developed by Biotime and Insilico Medicine, Inc. view more
Credit: Insilico Medicine
2018年1月4日，马里兰州巴尔的摩市：Insilico Medicine是一个总部位于巴尔的摩、致力于应用深度学习进行药物研发的新一代人工智能公司, 最新在 Oncotarget 发表了题为“应用深层神经网络群来识别胚胎 - 胎儿过渡标记：抑制胚胎和肿瘤细胞中的COX7A1 ” 的研究论文。 这代表了从2015年来和BioTime 合作的高潮，首次将深度神经网络 (DNN) 应用于分析由BioTime公司采用高度控制和标准化的实验所采集的基因表达数据。 BioTime的科学家们从几种胚胎干细胞系开始，将其分化成许多完全分化的细胞，搜集样本并分析在多个分化阶段的基因表达数据。
“在BioTime和AgeX，我们渴望使用最先进的技术来研究衰老和再生。我们与Insilico Medicine 合作，采用最前沿的深度学习方法，对不同分化阶段的样品进行分析。我们从这些方法中获取生物信息，鉴定跟癌症相关的基因，并进行了进一步的实验验证。我们首次在多种不同类型的癌症中，如乳腺，肺，肾，骨骼和肌肉，鉴定了这个异常表达的基因，” AGEX的CEO, Michael D. West 博士说。
一些与胚胎到胎儿的转变过程相关的基因，在多种癌症中均表达异常。特征重要性分析表明，COX7A1是最重要的一个基因。这些新发现很可能给诱导组织再生，癌症的诊断和治疗提供新策略。关于此研究具体信息以及AgeX的商业计划，参见 http://www.agexinc.com 短视频。
“我们很高兴能与AgeX合作， 将人工智能 (AI) 应用于再生医学领域。深度学习应用于生物医学的主要挑战之一是实验验证以及专家解析所需要的大量的时间投入。我们在2015年使用的技术已经可以成为头条新闻，但是我们更希望与BioTimes勤奋的科学家一起投入时间，为生物领域的探索做些贡献。我们希望利用这些经验开发更好的药物，使人类能够做的更多，寿命更长, 感觉更好，” Insilico Medicine 公司的CEO, Alex Zhavoronkov 博士说。
Insilico Medicine 计划在2018 年30多个会议上展示其AI 在药物研发和生物标记的研究成果。Alex Zhavoronkov 会在另一个 AI 龙头企业, Atomwise, 举办的 AI in Pharma Reception 以及1月8-10 号，加州旧金山，JP Morgan Healthcare 会议中举办的 WuXi Global Forum 2018 上演讲及小组讨论。会议期间Insilico也将现场演示其blockchain-和AI-平台:Longenesis , 旨在让个人拥有对与健康相关数据的控制权 。
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论文参考：
West M, Labat I, Sternberg H, Larocca D, Nasonkin I, Chapman K, Singh R, Makarev E, Aliper A, Kazennov A, Alekseenko A, Shuvalov N, Cheskidova E, Alekseev A, Artemov A, Putin E, Mamoshina P, Pryanichnikov P, Larocca J, Copeland K, Izumchenko E, Korzinkin M and Zhavoronkov A. Use of deep neural network ensembles to identify embryonic-fetal transition markers: repression of COX7A1 in embryonic and cancer cells, Oncotarget. 2017; in press, https://doi.org/10.18632/oncotarget.23748
关于AgeX Therapeutics
BioTime公司的子公司AgeX Therapeutics，Inc. （纽约证券交易所：BTX），是一家生物技术公司，致力于利用细胞永生化、再生生物学技术进行老化和年龄有关疾病的研究与治疗。公司最新开发的产品包括：多能性干细胞来源的褐色脂肪细胞 (AGEX-BAT1); 血管祖细胞(AGEX-VASC1); 诱导组织再生(iTR)。这些产品的可以应用于2型糖尿病，心脏缺血和组织再生。欲了解更多信息，请访问 http://www.agexinc.com 或通过 Twitter 或 Facebook 与公司联系。
关于BioTime
BioTime是一家后期临床生物技术公司，专注于开发和商业化治疗退行性疾病的产品。公司目前的临床项目针对三个主要领域，美容、眼科和细胞/药物输送。其临床方案基于两个平台技术：可以分化成为任何类型细胞的多能细胞、细胞/药物输送。 Renevia®，一个细胞/药物输送产品，去年早些时候达到了欧盟在用于治疗艾滋病患者面部脂肪萎缩的主要要求。并在去年晚些时候递交了Renevia®新药申请，预计2018年面市。OpRegen®，用于治疗发展中国家主要致盲的老年性黄斑部退化疾病。采用视网膜色素上皮细胞移植疗法，目前在进行一期和二期多中心临床试验。BioTime还拥有两家上市公司Asterias Biotherapeutics，Inc. （纽约证券交易所：AST）和OncoCyte（纽约证券交易所：OCX），和一家私人公司，AGEX Therapeutics 公司。 BioTime普通股在NYSE和TASE证券交易所上市，交易代码为BTX。欲了解更多信息，请访问http://www.biotime.com 或通过Twitter，LinkedIn，Facebook，YouTube 和Google+与公司联系。 要收到BioTime公司更多更新信息，请点击以下链接加入公司的电子邮件提醒列表：http://news.biotimeinc.com.
关于Insilico Medicine
Insilico Medicine 公司是位于巴尔的摩创新科技中心的生物技术医药公司，在6个国家拥有研发中心。该公司应用人工智能技术进行药物研发以及年龄相关的疾病研究，被业内人士广为认可。其在利用生成对抗网络 (GANs) 和强化学习 (RL) 进行药物开发取得开拓性成果，由此2017被NVIDIA评为具有社会影响力的5 家AI公司之一(Top 5 AI companies for social impact 2017)；2018年被CB Insight 评为前100的人工智能公司(Top 100 AI companies 2018)。公司致力于癌症、皮肤病，代谢和中枢神经系统疾病，肌肉减少症，纤维化和防衰老的药物发现。公司网站：http://www.insilico.com
欲了解更多信息，索取图片或采访，请联系：
朱青松，博士， emal: zhu@pharma.ai
Journal
OncoTargets and Therapy