image: (A) Mfd repair function. 1. An RNA polymerase is blocked by UV damage in DNA. 2. Mfd binds to RNA polymerase and DNA, and moves along the DNA to remove the RNA polymerase from the DNA. 3. By removing RNA polymerase, RNA is released and Mfd continues on its way, recruiting more DNA repair factors. (B) Mfd mutagenesis function. 1. When an RNA polymerase travels through the DNA to read its inscriptions, it causes the accumulation of left-handed braids (corresponding to overtwisted DNA) ahead of the protein and right-handed braids (corresponding to undertwisted DNA behind the protein. 2. When Mfd interacts with an active RNA polymerase and binds to DNA, the right-handed braids are concentrated in the small area between Mfd and the RNA polymerase, causing the DNA to unwind. RNA can then be inserted into the double helix and form a DNA:RNA hybrid, the R-loop. view more
Credit: © Terence Strick
- La protéine Mfd répare lADN des bactéries, mais peut aussi, à la surprise des scientifiques, favoriser leur mutation.
- Les mutations peuvent notamment induire une résistance des bactéries aux antibiotiques.
- Comprendre ce deuxième « rôle » de la protéine Mfd ouvre des perspectives pour combattre lantibiorésistance, mais aussi la résistance des tumeurs aux médicaments et traitements anti-cancéreux.
Toutes les bactéries, à laide dune protéine spécialisée, sont capables de réparer efficacement les lésions UV que subit leur ADN. Cependant, cette protéine nommée Mfd joue un autre rôle et entraîne des mutations. Une équipe* impliquant des scientifiques du CNRS, de lENS-PSL et soutenue par lInserm a mis en évidence et décrit ce phénomène. Mieux comprendre les mutations ouvre des perspectives dans la lutte contre les résistances aux antibiotiques et aux anti-cancéreux. Cette étude est publiée dans PNAS la semaine du 5 avril 2021.
LADN peut subir de nombreuses dégradations incluant celles par les rayons UV. Tout comme un éboulement de terrain sur une voie de chemin de fer empêchera un train de passer, les dégâts générés par les rayons UV constituent un obstacle à lARN polymérase, une protéine qui parcourt la longueur dun ADN pour lire ses instructions. Or, lARN polymérase bloquée sur un dégât empêche la réparation de ce dernier. Pour remettre « la voie » en état, les bactéries possèdent une protéine appelée Mfd qui déblaie lARN polymérase bloquée, puis recrute dautres protéines pour aider à la réparation, évitant lapparition de mutations.
Des biologistes de lInstitut de biologie de l'ENS (CNRS / ENS PSL / Inserm) viennent de mettre en évidence un rôle jusque-là moins connu de cette protéine. En effet, elle est impliquée dans la formation de zones de lADN où les mutations apparaissent plus facilement.
La machinerie cellulaire impliquant la protéine Mfd répare normalement lADN mais quand une bactérie fait face à certains stress, comme la présence dun antibiotique, elle emprunte une autre voie : Mfd sagrippe à une ARN polymérase active en train de parcourir lADN, plutôt que de déblayer une ARN polymérase bloquée. Une fois liées, ensemble les deux protéines déroulent rapidement et à grande échelle la double hélice dADN jusquà louvrir. Louverture du double brin dADN va créer un milieu propice pour la formation de zones particulières facilitant les mutations : les R-loops.
Les R-loops sont des structures encore peu comprises mais elles sont la source de nombreuses mutations : les scientifiques ont montré que près de la moitié des mutations chez les bactéries étaient dues à ces structures. Les résistances aux antibiotiques naissant des mutations, ces travaux, qui démontrent le lien entre Mfd et les R-loops, ouvrent de nouvelles perspectives dans la lutte contre lantibiorésistance.
Léquipe de recherche souligne également que Mfd a des équivalents dans les diverses branches du vivant et que ce mécanisme de mutation est sans doute universellement présent. Chez lhumain par exemple, lhomologue de la protéine Mfd est impliquée dans le vieillissement accéléré et également dans certains cancers. Les scientifiques pensent quun mécanisme semblable à la formation des R-loops pourrait se produire dans les cellules cancéreuses, introduisant des mutations capables de les rendre résistantes aux traitements.
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*Des scientifiques de lInstitut de biologie de l'Ecole Normale Supérieure (CNRS/ENS - PSL/Inserm) sont impliqués dans ces recherches
Journal
Proceedings of the National Academy of Sciences