image: Historically reconstructed introduction routes of Y. pestis for available 18th century genomes, consisting of multiple spatio-temporal waves. Locations shown and highlighted on the map are discussed in this study. Sites for which genomic data was published in previous studies are marked with an asterisk. Basemap from wikicommons. view more
Credit: Image credit: Meriam Guellil
这组作者说，从在黑死病事件之后死亡的个体身上分离出的基因组序列将病原体鼠疫杆菌的一个储存宿主指向了西欧之外，它引发了之后的暴发。在黑死病发生之后5个世纪，欧洲持续遇到了鼠疫暴发，直到17世纪开始缓慢下降。为了发现这种病原体的动态， Meriam Guellil、Barbara Bramanti及其同事从来自4个不同地区的个体身上分离出了9个鼠疫杆菌的基因组并测序。这些菌株之中的7个是从14世纪和17世纪死于意大利的个体身上分离出来的，而另外两个菌株是从18世纪分别死于斯堪的纳维亚和高加索地区的两人体内分离出的。把这些序列与此前的序列以及历史数据结合起来，这组作者重建了鼠疫杆菌引入欧洲的流。斯堪的纳维亚和高加索的基因组序列都拥有类似于造成了1722年马赛大瘟疫的一个菌株的大的删除。对历史来源的分析提示，这一菌株在一次单独的引入中到达了车臣地区，或许是来自一个共同的储存宿主。这组作者说，接近欧洲边缘的欧亚大陆的一个野生生物储存宿主可能引发了这些鼠疫流行。
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Journal
Proceedings of the National Academy of Sciences