La plataforma "MIDAS" detecta interacciones proteína-metabolito

A fin de ayudar a mejorar el descubrimiento y la caracterización de las esquivas interacciones entre proteínas y metabolitos, los investigadores presentan MIDAS ("Mass spectrometry Integrated with equilibrium Dialysis for the discovery of Allostery Systematically", espectrometría de masas integrada con diálisis de equilibrio para el descubrimiento de alosterios sistemáticamente). Según los autores, MIDAS representa una nueva y poderosa herramienta para "identificar, comprender y explotar modos de regulación metabólica previamente desconocidos en todo el interactoma de proteínas y metabolitos". Las interacciones entre proteínas y metabolitos de molécula pequeña se encuentran entre los tipos más comunes y fundamentales de interacción biológica y desempeñan un papel vital en la regulación de las funciones de las proteínas y el control de diversos procesos celulares. Sin embargo, el descubrimiento y la caracterización de las interacciones proteína-metabolito (IPM) ha sido esporádico y complejo. Para abordar esta cuestión, Kevin Hicks y sus colegas desarrollaron la plataforma MIDAS, que permite el descubrimiento sistemático de IPM esquivas. Usando MIDAS, Hicks et al. analizaron las interacciones de 33 enzimas del metabolismo de carbohidratos humanos y 401 metabolitos, que revelaron 830 IPM. Si bien MIDAS identificó las IPM con reguladores, sustratos y productos previamente conocidos, este enfoque también permitió a los autores descubrir muchas IPM previamente desconocidas de diversas vías metabólicas, incluida la regulación de la lactato deshidrogenasa por ATP y la acil coenzima A de cadena larga. Según los autores, este hallazgo podría ser un mecanismo subyacente a la relación fisiológica inesperada entre el metabolismo de las grasas y los carbohidratos en diferentes tejidos y podría explotarse terapéuticamente para bloquear la glucólisis aeróbica en cánceres.