研究人员推出了“sci-Space”，这是一种研究空间转录组学的新方法，它保持的单细胞分辨率和空间异质性规模比以前所用的方法要高得多。他们用他们的方法构建了小鼠胚胎发育 14 天时的全切片单细胞图谱。单细胞 RNA 测序法在理解生物体和复杂组织如何发育方面取得了巨大进步。尽管细胞的空间构建是正常发育、体内平衡和病理生理学的核心，但许多单细胞 RNA 测序方法却会失去有价值的空间信息的环境背景。那些能保留细胞间空间背景的信息可能局限于一组特定的基因和/或小面积的组织。为战胜这些挑战，Sanjay Sirvatsan 和同事开发了 sci-Space，这是一种空间转录组学方法，它在保留单细胞分辨率的同时还能在更大的尺度上解析细胞的空间环境背景。Sirvatsan 等人的方法使用的是一种条形码寡核苷酸（即合成的 DNA 单股短链）网格，这些寡核苷酸可以从某载玻片转移到覆盖的冷冻组织切片的细胞核内。据作者披露，可用sci-Space 从每张载玻片获得数千个细胞的空间起源和转录组。为了展示他们的新技术，Srivatsan 等人将 sci-Space 应用于正在发育的小鼠胚胎。通过捕获近 12 万个细胞的空间坐标和全部转录组，作者组装了发育第14天的小鼠胚胎全部切片的单细胞图谱，揭示了各种类型细胞（包括正在分化的神经元）的基因空间表达。
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