在保育规划中，淡水物种有时会是在事情发生后再被重视的对象，因为在该规划中，陆地生态系统及其中的物种常被优先考虑。但是，一项新的研究披露，通过将水生物种的保护需求纳入传统上的以陆地为重点的保育规划中，热带淡水生态系统的保护会大为改善且不会伤及保护陆地物种的目标。尽管淡水生态系统仅占地球表面的1%以下，但它们含有近10％的所有已知物种，其中包括所有脊椎动物的1/3。它们也是受到最大威胁的生态系统之一：其衰减速度近乎陆地或海洋生态系统衰减速度的两倍。但是，尽管它们在保护全球生物多样性方面至关重要，保护淡水物种却常常成为保育规划中的亡羊补牢之举。绝大多数的保护区的设计和保护策略都将陆地生态系统和物种置于优先地位，并通常会假定其所包含的任何淡水系统也会因而受益。应用亚马逊地区1500多种陆地和淡水物种数据，Cecília Leal和同事对这两个体系内的物种保护进行了模拟，结果发现，这些假设实际上远非准确。据研究结果披露，以陆地为重点的保护规划仅能提供以淡水为重点的保护规划所能实现的平均淡水系统保护效益的22％。然而，Leal等人发现，通过使用陆地-淡水综合保护法，对淡水物种的保护最多可增加至600％，而对陆地物种的保护仅减少了1％。即使在缺乏淡水生物多样性详细数据的热带区域（情况常常如此），用陆地-淡水综合保护法仍可使保护效益加倍。Robin Abell 和 Ian Harrison在相关的《视角》中写道：“任何优先考虑规划总会有相关的得失，但是Leal等人的研究（结合对健全的淡水系统及其流域多重裨益的辅助分析）提示，这些得失可能比我们所想的更容易被接受。 ”
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