News Release

正确组装基因序列的准确率接近100%

Peer-Reviewed Publication

American Association for the Advancement of Science (AAAS)

科研人员已经大大改进了从头组装基因序列的技术,他们以正确顺序组装人类基因组的准确性已经达到99%以上。同样地,他们将该技术用于传播疾病的两种蚊虫的基因组,为人们了解这些物种的祖先提供了重要的线索。这一进步将加快对许多生物体的基因组分析。如今测序的大多数基因组是通过产生的短序列DNA碎片决定的,通过计算,这些短碎片序列像拼图一样被拼接在了一起。Hi-C是一种基于序列的将这些基因序列拼接在一起的方法,它是沿着染色体内支架将基因序列按次序和定向进行排列的。然而,鉴于染色体内基因物质是如此紧凑且紧密盘绕,因此,尝试组装基因组很容易会发生错误。在这项研究中,Olga Dudchenko和同事研发出了一种技术,它能确定某支架长距离接触模式突然改变的位置,从而提示支架的定位已经不再正确。同样地,他们研发了一种新的算法,它能更好地对这些基因序列进行锚定、排序和定向。作者用这一改良的Hi-C技术来组装人类基因组,他们发现99%的基因序列符合人类基因组的标准参照,而且支架中93%的定向是正确的。接着,该团队用这一技术来组装传播疾病的两种蚊子的基因组;这两种蚊子是埃及伊蚊和致倦库蚊,前者是兹卡病毒的传播媒介,后者则是西尼罗病毒的载体。他们的数据对这两种蚊子有着共同的祖先提供了线索,这能帮助科学家在将来更好地了解控制这些传播媒介的途径。

###


Disclaimer: AAAS and EurekAlert! are not responsible for the accuracy of news releases posted to EurekAlert! by contributing institutions or for the use of any information through the EurekAlert system.