News Release

在拉沙病毒疫情腹地进行病毒基因组测序

Peer-Reviewed Publication

American Association for the Advancement of Science (AAAS)

在2018年拉沙病毒爆发高峰时第一批部署某种移动式纳米孔测序技术来评估病毒基因组的研究人员如今报告了他们的结果。据他们的新的研究披露,这种新兴的技术能在实地对可能的疫情爆发进行实时表征,回答有关病毒株类型及传播途径等时间上敏感的问题。拉萨热是西非地区流行的一种病毒性出血热疾病,该病主要是由进食遭感染鼠类污染食物而传播给人的。在整个西非地区,拉沙病毒感染病例一直呈稳定上升,但在过去几年中,其上升速度变慢;通常来说,每年只有若干新病例报告。然而,在2018年初发生在尼日利亚的拉沙病毒感染病例的急剧飙升预示了早期的爆发,并引发了可能出现一种新的毒力更强病毒株(即会有更高传播率的病毒株)的恐惧。Liana Eleni Kafetzopoulou和同事对这些顾虑做出了反应,他们采用了一种新的基因组技术(即用小型便携式牛津纳米孔MinION装置的宏基因组纳米孔测序技术),它能在疾病爆发进展之时直接用临床标本对病毒基因组进行快速、移动性测序。通过在为期7周的时间内对总共120个拉沙病毒阳性样本进行测序,Kafetzopoulou等人试用了该装置。这些详细的结果无法结论性地提示该次疫情应归咎于某种新型病毒株,它们也不能揭示该病毒已转变为人与人之间的传播。但它们确实表明,鼠源性污染是造成该次爆发的主要驱动因素。据作者披露,该技术能够在疾病爆发初期快速提供详细且实时的病原体表征减轻了对新病毒株及未知传播媒介的顾虑。这也能让公共卫生当局恰当地做出反应和资源分配。在一篇《视角》文章中,Nahid Bhadelia提出,对像移动纳米孔测序等新技术的真的考验是它会变得多么容易获取和普及;像拉沙这样危险病毒容易流行的大部分地区缺乏任何类型的诊断技术、实验室或者其它资源。

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