マサチューセッツ州ケンブリッジ、5月28日 — Insilico Medicine（「Insilico」）は本日、華東医薬株式会社の研究パートナーとの協力により、WDリピート含有タンパク質5（WDR5）-MYCタンパク質間相互作用を強力に標的とする新規低分子阻害剤の発見を発表した。この研究では、Insilicoの先駆的なジェネレーティブ人工知能（AI）と物理学ベースの分子モデリングモジュールが活用された。本研究は『Chemical Biology & Drug Design』誌に掲載された。
MYCタンパク質は、ヒトがんの最大70%において確立されたドライバーであるが、高親和性低分子阻害剤に適した結合ポケットがないため、長らく「ドラッガブルでない」と考えられてきた。しかし、最近の研究により、MYCとWDリピート含有タンパク質5（WDR5）の相互作用がMYCの腫瘍原性活性に必須であることが明らかになり、薬剤開発における有望な新たな治療標的となっている。
研究チームは当初、ジェネレーティブAI搭載のChemistry42プラットフォームを使用してWDRを標的とする低分子阻害剤を生成した。リガンドベースの分子生成技術を適用し、重要なファーマコフォアを保持するためのアンカーポイントを組み込むことで、チームは化合物8（IC50 = 16.35 μM）と化合物9（IC50 = 1.91 μM）を発見した。両化合物は参照化合物（IC50 = 20.86 μM）と比較して大幅に改善された阻害活性を示した。
さらに、Chemistry42の物理学ベースツールAlChemistryのサポートにより、これらのヒット化合物をサブマイクロモル結合親和性を持つリード化合物へと精製した。特に、その中の一つのリード化合物9c-1は、化合物3と比較して35倍の活性向上を示し、サブマイクロモル結合親和性を達成した。この分子は重要な進歩を示し、治療応用のための効果的なWDR5-MYCタンパク質間相互作用（PPI）阻害剤開発の有望な候補として機能する。
「この研究は、我々のAI搭載プラットフォームが薬剤発見における新たな可能性を迅速に開拓できることを改めて実証しており、特に以前はドラッガブルでないと考えられていた標的に対してその力を発揮しています」と、Insilico Medicineの化学・DMPK部門責任者兼薬物化学シニア・バイス・プレジデントのXiao Ding博士は述べた。「この研究からの前向きな結果は、ジェネレーティブケミストリーモジュールと物理学ベースモデリングモジュールを組み合わせた力だけでなく、最先端科学を満たされていない高い医療ニーズを持つ患者のための有望な治療候補に変換する真の可能性をも浮き彫りにしています。」
Insilicoは2016年に査読付きジャーナルで新規分子設計にジェネレーティブAIを使用するコンセプトを初めて記述し、その後商業利用可能なPharma.AIプラットフォームの開発を続けてきた。最先端のAIと自動化技術を統合することで、Insilico Medicineは通常2.5～4年を要する従来の薬剤発見方法と比較して、初期薬剤発見・開発プロセスにおいて大幅な効率向上を達成している。2021年から2024年にかけての22の内部薬剤候補プログラムに関する最近の主要なタイムラインベンチマークで発表されたように、Insilicoは平均DC到達時間わずか12～18ヶ月、プログラムあたり60～200分子の合成・試験という卓越したパフォーマンスを実証している。
Insilico Medicineについて
Insilico Medicineは、ジェネレーティブAIを活用したグローバルな臨床段階のバイオテクノロジー企業であり、次世代AIシステムを使用して生物学、化学、医学、科学研究を結びつけている。同社は、新規標的発見と望ましい特性を持つ新規分子構造の生成のために、深層生成モデル、強化学習、トランスフォーマー、その他の現代的機械学習技術を活用するAIプラットフォームを開発している。Insilico Medicineは、がん、線維症、中枢神経系疾患、感染症、自己免疫疾患、老化関連疾患に対する革新的な薬剤を発見・開発するための画期的ソリューションを開発している。詳細については、www.insilico.comをご覧ください。
Journal
Chemical Biology & Drug Design